先附上查重的sql以供验证：

select username, count(*) as num from user GROUP BY username HAVING count(*)>1;

接下来，就需要将username重复的用户删除到只剩一条记录。
第一步：查询出重复记录中id最小的记录。

select min(id) id, username from user GROUP BY username HAVING count(*)>1;

接下来，以此结果为条件，进行关联查询，将重复数据中，id大于上述结果中id的数据删除。就意味着重复数据只保留了一条。也就是保留下来id最小的那条数据。
最终sql：

delete user from user, 
(select min(id) id, username from user GROUP BY username HAVING count(*)>1) t2
where user.username=t2.username 
and user.id=t2.id

实现了想要的效果~！

如果是多条件的话，只需要在查询条件中添加多个过滤条件就可以了。
例如：用户名、性别、电话同时重复的记录查重保留一条记录。

delete user from user, 
(select min(id) id, username from user GROUP BY username, 
gender, phone HAVING count(*)>1) t2
where user.username=t2.username 
and user.gender=t2.gender 
and user.phone=t2.phone 
and user.id=t2.id